一场跨越半个世纪的诉讼即将在东京地方法院展开。中国细菌战受害者代表将以原告身份走上日本法庭，直面这个国家至今尚未清算的战争责任，要求日本政府正式谢罪并作出赔偿。被告方以证据不足以证明日本政府曾在华实施细菌战为由进行辩护，庭审一时陷入僵局。
时间回到1941年冬天，玉兰本不愿让嫂子担心，但既然桂芬问起，她便如实说出看见佟长富和长根逃跑的事。她已派人去打听消息，相信不久便会有回音。抗联队员将佟长富和长根救回，安置在老酸缸的隐蔽处。佟长富见到这些抗联同志，有的缺了胳膊，有的少了腿，却依然坚持游击抗战，心中深感敬佩，同时对出卖自己的小岛幸夫恨之入骨。
严炳瑞发现往返于警察厅与731部队之间的运输队不再出现，推测他们已更换审讯和关押犯人的地点，当前最要紧的是查出这个新地点。玉兰前往荟芳里向德凤打听消息，德凤曾听一名日本兵提起过731部队，答应试着探听更多情况。抗联的石碾子和老烟锅已是第二次救下佟长富几人，他们告诉佟长富和长根，只要敢开枪打鬼子，就能加入抗联。
抗联的弟兄们个个血性刚强，不畏牺牲，哪怕拼上性命，也绝不让鬼子睡一夜安稳觉。离家仅隔一个岗哨的距离，长根做出了选择：他要留在抗联，杀敌报国。佟长富劝不动他，只得独自返回。德凤打听出那名日本兵确实隶属731部队。玉兰便悄悄登上那辆车，来到中东医院外，在另一辆车上发现了一本特别通行证。
佟长富回到家中，将长根的决定告诉了他的母亲。老太太最终接受了事实，但拒绝随佟长富一家离开此地。年关将近，荒川被安排为石井四郎绘制肖像。经历激烈的思想斗争后，荒川拨通国际电话回家，向父亲提出想返回故乡，理由是无法适应满洲部队的生活。严炳瑞怀疑警察厅那份特别移送名单就藏在9号房间，但最快也要明晚才能行动，此刻他们绝不能冒任何风险。
佟长富去找钱爷办理出国证件，钱爷没收他的钱，而是以送货作为交换条件。只要佟长富把货送到，钱爷就帮他办证。表面上这批货是运往江边的牛粪，实际上牛粪下面藏着抗联所需的物资。一听是送给抗联的东西，佟长富当即答应下来。一路走到现在，佟长富早已不是当初那个胆小怕事的窝囊废，见识过抗联同志的英勇奋战后，他更觉得自己应当贡献一份力量。
荒川失魂落魄地回到部队，望见窗外烟囱冒着黑烟，循着刺鼻的气味来到一处深坑。当他看清坑中之物时，顿时胃里翻腾，呕吐不止。父亲的话语在耳边回响，母亲早在一个月前就已离世。直到去世那一刻，母亲仍坚信荒川在满洲过着幸福的生活。家乡小镇已不同往昔，父亲决定卖掉昆布店，他并不赞成荒川离开满洲返回小镇。
小岛幸夫登门道歉，顺便给佟长富一家送来全家福照片。佟长富将他痛骂一顿，玉兰也恨不得杀了小岛幸夫。小岛幸夫内心愧疚，解释说自己当时被日本兵用枪指着，无能为力。如今他只愿赎罪，希望通过佟长富找到那位从731部队逃出的幸存者，对其进行采访，用摄像机记录下731部队的罪行。小岛幸夫言辞恳切，佟长富选择再次相信他，借送货之机将小岛幸夫也带到江边，用鸟叫声唤出抗联同志。小岛幸夫转过身，竟意外看见了严炳瑞。严炳瑞一见到他，冲上来便打。
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